Le contenu des résumés non techniques (RNT) est rédigé à des fins de communication par les établissements d'expérimentation animale. Ces résumés sont donc soumis, au minimum, au biais de désirabilité sociale, qui peut avoir pour conséquence de mettre en avant de manière détaillée les bénéfices attendus et de limiter les détails et la description des contraintes imposées aux animaux. Par ailleurs, n'étant pas sourcées ni soumises à une relecture par les pairs, les affirmations contenues dans les RNT sur des sujets scientifiques n'ont aucune valeur de preuve, mais fournissent des indications sur le cadre théorique dans lequel les établissements travaillent.

Objectifs et bénéfices escomptés du projet

Décrire les objectifs du projet.

Le terme microbiote désigne une communauté de microorganismes qui occupent une niche écologique, qui peut être partiellement décrite par l’ensemble des genres bactériens qui la compose. Les organismes vivants cohabitent avec de telles communautés. Chez les animaux, elles colonisent un certain nombre de surfaces et notamment les cavités orales, nasales ou intestinales. Un des microbiotes qui a plus particulièrement été étudié ces dernières années est celui de l’intestin, puisqu’il participe au processus de digestion et contribue à la santé de son hôte. Pour les animaux d’élevage, la compréhension des mécanismes qui interviennent dans l’installation, le maintien ou l’évolution du microbiote intestinal au cours de la vie d’un animal est essentielle. Dans ce projet, notre objectif est d’établir si la différence de composition des microbiotes des intestins induite par une selection génétique en milieu tempéré est affecté par l’élevage en conditions tropicales. Dans ce but, nous réaliserons différents prélèvements dans deux lignées de porcs connues pour avoir des microbiotes différents en milieu tempéré. Du sang sera prélevé pour l’étude de marqueurs génétiques et métaboliques du porc. Les fécès produits spontanément seront utilisés pour vérifier la composition du microbiote intestinal. Ces paramètres seront mis en regard de l’état de santé global des animaux.

Quels sont les bénéfices susceptibles de découler de ce projet?

A court terme, le projet amènera des informations sur la composition de différents microbiotes, leur évolution avec l’âge du porc et leur association à des marqueurs génétiques et métaboliqes du porc dans différentes conditions d’élevage. A plus long terme, d’un point de vue plus appliqué, ces connaissances pourront être utilisées en sélection pour améliorer, via la prise en compte de la composition du microbiote, la santé des animaux.

Nuisances prévues

À quelles procédures les animaux seront-ils soumis en règle générale?

Les animaux du projet sont pesés 6 fois, à la naissance, à 21 jours, à 28 jours au sevrage, à 70 jours, à 84 jours en fin de post sevrage, et en fin d’engraissement vers 160 jours d’âge, avec une mesure de l’épaisseur de gras dorsal par ultrasons. Une pesée dure une quinzaine de secondes. Au sevrage et en fin de post sevrage, elle est réalisée durant le changement de local des animaux. Une prise de sang est réalisée à 60 jours d’âge. Au même moment, il y a une collecte de fèces suite à une défécation spontanée. L’intervention impliquant la saisie de l’animal, sa contention et son isolement en position dorsale pour réaliser les prélèvements de sang et de fèces dure environ 3 minutes. Juste avant la prise de sang, un prélevement de salive par présentation d’un coton salivaire à machouiller est réalisé. Une collecte de fèces est réalisée à 120 jours à partir d’une défécation spontanée.

Quels sont les effets/effets indésirables prévus sur les animaux et la durée de ces effets?

La saisie de l’animal provoque un stress léger et temporaire pour l’animal attrapé et pour ses congénères au niveau de la case d’hébergement. Le prélèvement de sang provoque une douleur légère et transitoire. Chaque pesée cause un stress léger et transitoire en raison de l’isolement et de la contention de l’animal nécessaire à une pesée individuelle.

Justifier le sort prévu des animaux à l’issue de la procédure.

Les animaux sont remis en conditions d’élevage.

Application de la règle des "3R"

1. Remplacement

3R / Remplacement :

Les mesures sur le porc sont requises car il s’agit de l’espèce cible. L’objectif est d’explorer dans cette espèce l’influence du milieu tropical sur le microbiote intestinal et les relations avec les paramètres sanguins et la thermorégulation. Il n’existe ni modèle in vitro ni modèle in silico permettant d’obtenir ces résultats.

2. Réduction

3R / Réduction :

Le nombre d’animaux est réduit au minimum pour obtenir des résultats exploitables et fiables en terme statistique.

3. Raffinement

3R / Raffinement :

Les animaux sont élevés avec un enrichissement du milieu adapté au porc incluant des cordelettes, des sacs en toile de jute, des chainettes et des ballons. Pour la prise de sang, la saisie et la contention des animaux sont réalisées par les membres du personnel expérimenté en charge du soin des animaux, auxquels les animaux sont familiarisés. Les prélèvements de sang et de salive se font par des techniques maitrisées qui limitent la durée de contention de l’animal. Les points limites ont été établis en fonction d’une grille d’observation des animaux. Lorsqu’un point limite est atteint, le responsable d’élevage agit selon le plan établit avec le vétérinaire d’élevage, en accord avec le porteur du projet.

Expliquer le choix des espèces et les stades de développement y afférents.

Le porc est l’espèce cible. Afin d’améliorer les conditions d’élevage du porc (bénéfice à long terme du projet), il est essentiel d’utiliser cette espèce. Les animaux sont étudiés entre la naissance et la fin d’engraissement. L’âge de 60 jours retenus pour le prélèvement de sang, de fèces et de salive, correspond à une phase précoce de stabilisation du microbiote intestinal après le passage à l’aliment solide au moment du sevrage. L’âge de 120 jours retenu pour le deuxième prélèvement de fèces correspond à la fin d’engraissement à un stade où les animaux ne sont pas encore pubères.