Génotypage invasif des lignées transgéniques

Les animaux produits dans l’animalerie sont nécessaires pour des projets scientifiques validés par différents organismes scientifiques, projets pour lesquels il n’existe aucune méthode alternative in vitro ou in silico. Avant de déposer cette demande, une alternative non-invasive (arrachage de bulbe pileux) a été testée mais n’a pas donné de résultats exploitables. De plus, cette méthode, ainsi que d’autres méthodes non-invasives (analyse de fécès, prélèvement buccal) entraînant toutes un niveau de stress équivalent à la biopsie invasive caudale ou auriculaire, n’ont pas été retenues.

L’animalerie élève de nombreuses lignées transgéniques au phénotype non dommageable pour prélèvement de tissus ou pour des protocoles d’expérimentation animale. L’élevage a pour but de produire les animaux nécessaire à l’expérimentation. Le maintien des lignées par croisement nécessitant un génotypage est nécessaire pour éviter une dérive génétique par croisement consanguin, et pour la production de contrôles dans la même portée. Cela contribue à diminuer la variabilité du fond génétique des animaux et donc des résultats, permettant la réduction du nombre d’animaux nécessaires aux expériences. Selon les lignées et les projets, au moins la moitié des animaux n’ont pas le génotype nécessaire à l’expérimentation, environ un quart est utilisé pour prélèvement de tissu, et un autre quart dans des projets scientifiques validés par le ministère. Lorsque c’est possible, les animaux qui n’ont pas le génotype adéquat sont réutilisés dans des projets indépendants de leur génotype (estimé à 5000 animaux sur 5 ans).

Les méthodes de prélèvement (biopsie auriculaire ou caudale) et de marquage (boucle d’oreille lors du sevrage, ou tatouage digital avant sevrage) ont été choisies pour minimiser l’inconfort en fonction de l’âge des animaux (et donc du développement de la queue et de l’oreille). La biopsie auriculaire prélevée lors du marquage au sevrage des animaux n’induit pas de stress supplémentaire par rapport au marquage. Cette méthode n’induit pas de signes majeurs d’incomfort, et du fait que l’oreille est très peu vascularisée, n’engendre pas de saignement. Dans le cas de biopsies précoces, quand l’oreille n’est pas assez développée, la biopsie est prise sur l’extrémité de la queue, qui n’est pas ossifiée dans les 15 jours après la naissance. Le saignement est minime (moins d’une goutte) et s’arrête immédiatement. Le marquage comme le prélèvement sont réalisés avec du matériel adapté, le geste est rapide et sûr, réalisé en routine par du personnel formé. La mise en place d’un anesthésique et/ou analgésique serait plus stressante que le geste lui-même. Les animaux sont surveillés quotidiennement par les animaliers. Ainsi, de même que pour tous les animaux de l’élevage, biopsiés ou non, si une infection ou signe d’inconfort est observé, un incident est rapporté concernant l’animal. Un traitement adapté est alors décidé, en accord avec l’utilisateur et sur la base de point-limites pré-établis. Si l’utilisateur n’est pas joignable, la décision est prise par le soigneur, avec le vétérinaire si nécessaire.