Résumé non technique d'un projet d'expérimentation animale publié sur ALURES le 2024-06-10 00:00:00
("EC NTS/RA identifier" : NTS-FR-805005)
Les 90 souris de ce projet reçoivent du sulfate de dextran sodique, qui provoque une inflammation de la muqueuse intestinale, puis un gavage oral de bactéries. Elles subissent des procédures d’un niveau de souffrance léger à modéré, avec un point limite fixé à 20 % de perte de poids. Le porteur qualifie le gavage de geste rapide d’environ cinq secondes et affirme que les souris ainsi traitées ne développent « aucun signe pathologique », ce qui laisse de côté la colite chimique qu’il déclenche lui-même. Toutes sont tuées après chaque procédure, l’objet du projet étant de mesurer si des souches d’Escherichia coli isolées de patients atteints de la maladie de Crohn prolifèrent mieux dans un intestin enflammé.
Résumé produit par un modèle de langage à partir du seul texte du laboratoire, selon une méthode arrêtée par l’OXA. Publié sans relecture individuelle préalable, sous la responsabilité de l’association, et corrigé au fil des relectures.
Objectifs et bénéfices escomptés du projet, selon le laboratoire
Réponses rédigées par le laboratoire demandeur, à des fins de communication. Elles ne sont ni sourcées ni relues par des pairs.
Décrire les objectifs du projet.
Note de l'OXA. Cette question est celle du formulaire européen de résumé non technique. Elle est posée au laboratoire qui demande l'autorisation, et sa réponse est écrite avant que la première procédure commence (arrêté du 1er février 2013, art. 5). Ces objectifs servent à justifier l'utilisation des animaux devant le comité d'éthique. Aucun document public ne dira ensuite s'ils ont été atteints : la directive permet aux États de faire mettre à jour le résumé avec les résultats de l'appréciation rétrospective (directive 2010/63/UE, art. 43), la base européenne prévoit de les recevoir, et aucune entrée française n'en porte (base ALURES).
Dans quel but fait-on ça ? · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
Il est désormais établi que de nombreuses pathologies humaines sont associées à une altération du microbiote intestinal (dysbiose). Ce déséquilibre est souvent caractérisé par une prolifération des bactéries de la famille des Enterobacteriaceae. Comprendre l’origine de cette multiplication et les mécanismes associés permettra d’envisager des solutions thérapeutiques pour réduire la dysbiose et rétablir des conditions d’homéostasie favorables à la santé des patients. Notre projet vise à démontrer le rôle de de la capacité métabolique des souches d’Enterobacteriaceae à proliférer dans le tractus gastro-intestinal des patients lors d’une dysbiose. Suite à des travaux de criblage réalisés in vitro, notre équipe a démontré que les souches d’Escherichia coli isolées de patients atteints de la maladie de Crohn peuvent cataboliser la forme D de l’acide aminé Sérine, alors que les isolats provenant d’individus sains ne le peuvent pas. Cette capacité confère un avantage nutritionnel aux souches issues de patients dans un modèle de co-culture in vitro. L’objectif est désormais d’évaluer si ce déterminisme existe également dans un environnement digestif complexe, et notamment dans un contexte inflammatoire tel que celui observé chez les patients atteints de la maladie de Crohn. Pour cela, nous prévoyons d’utiliser la souris comme modèle animal pour évaluer le fitness de souches représentatives de celles caractérisées lors de nos travaux in vitro.
Quels sont les bénéfices susceptibles de découler de ce projet?
Note de l'OXA. Le formulaire européen demande les bénéfices « susceptibles de découler » du projet. Il appelle donc une projection, et il l'obtient : ce que le laboratoire écrit ici est ce qu'il espère, avant d'avoir commencé. Deux chercheuses ont repris six corpus d'études précliniques déjà menées et pesé les dommages réellement infligés aux animaux contre les bénéfices cliniques réellement obtenus : moins de 7 % de ces études ressortaient défendables (Pound et Nicol, 2018).
Est-ce « inutile » ou « nécessaire » ? · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
La réalisation du projet permettra de valider les hypothèses formulées suite à la réalisation de travaux in vitro. Comprendre pourquoi et comment les Enterobacteriaceae prolifèrent dans l’intestin des patients constituera une base solide pour imaginer des solutions thérapeutiques et/ou préventives, en particulier via une alimentation adaptée, pour limiter les dysbioses et ainsi rétablir des conditions d’homéostasie favorables à la santé des patients.
Nuisances prévues, selon le laboratoire
Réponses rédigées par le laboratoire demandeur, à des fins de communication. Elles ne sont ni sourcées ni relues par des pairs.
À quelles procédures les animaux seront-ils soumis en règle générale?
Note de l'OXA. La formule « en règle générale » autorise une réponse générale, et c'est l'un des points sur lesquels les examens de qualité trouvent ces documents défaillants. Un examen publié en 2018 a établi que les résumés allemands et britanniques décrivaient mal ce qui est fait aux animaux et ce que ceux-ci pourraient éprouver (Taylor et al., 2018). L'adoption d'un modèle commun européen a nettement amélioré le premier point, à peine le second (Taylor et al., 2024).
Le droit d'accès aux documents · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
Les animaux subiront un gavage oral une seule fois lors de la procédure, un geste rapide (~5 sec) qui sera réalisé par du personnel qualifié.
Quels sont les effets/effets indésirables prévus sur les animaux et la durée de ces effets?
Note de l'OXA. C'est l'endroit du document où les animaux devraient apparaître, et c'est celui qui résiste. Un nouvel examen, publié en 2024, a mesuré que cinq des six éléments attendus sur les dommages prévus progressaient depuis l'adoption d'un modèle commun européen. Les effets indésirables sont le sixième : 41 % des résumés allemands et 48 % des britanniques les décrivent complètement. Les auteurs relèvent aussi des effets présentés comme minimes sur des projets classés modérés ou sévères (Taylor et al., 2024). Ces mesures portent sur l'Allemagne et le Royaume-Uni. L'examen de 2018 classait la France parmi les pays les moins bons pour l'identification, l'accessibilité et la qualité de ses résumés, sans les noter rubrique par rubrique (Taylor et al., 2018). Les résumés français suivent aujourd'hui le modèle européen commun.
Les animaux souffrent-ils ? · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
Notre expérience antérieure a démontré que les souris gavées avec des souches commensales d’E. coli ne développent aucun signe pathologique ou de mal-être. Cependant, un suivi régulier sera réalisé au cours de l’expérimentation et permettra le cas échéant de rapidement identifier l’apparition éventuelle de mal-être ou de souffrance chez les animaux. Le traitement des souris au DSS provoque une inflammation de la muqueuse intestinale. Ce traitement est fréquemment employé dans le cadre de recherche sur les maladies inflammatoires de l’intestin telles que la maladie de Crohn. Une surveillance quotidienne des animaux sera effectuée à travers la prise de poids et la recherche de signes de mal-être. Si un animal présente une perte de poids supérieure à 20% de son poids initial et/ou présente des symptômes visibles de souffrance, il sera sorti de l’expérience puis euthanasié si nécessaire selon la réglementation en vigueur.
Justifier le sort prévu des animaux à l’issue de la procédure.
Note de l'OXA. Le formulaire demande de justifier ce sort, non de le décrire. L'analyse dommage-avantage que la directive impose au comité d'éthique porte sur « la souffrance, la douleur et l'angoisse » infligées aux animaux (directive 2010/63/UE, art. 38). Quand ce sort est la mise à mort, celle-ci ne figure donc pas parmi les dommages que le comité met en balance avec les bénéfices annoncés. L'OXA écrit « mise à mort » plutôt que « sacrifice », qui emprunte au registre du don consenti, ou « euthanasie », qui désigne une mort décidée dans l'intérêt de celui qui meurt.
Peut-on parler d'éthique en expérimentation animale ? · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
L’ensemble des animaux sera euthanasié après chaque procédure expérimentale
Application de la règle des "3R", selon le laboratoire
Réponses rédigées par le laboratoire demandeur, à des fins de communication. Elles ne sont ni sourcées ni relues par des pairs.
1. Remplacement
Note de l'OXA. La directive demande au résumé « une démonstration de la conformité » aux exigences de remplacement, de réduction et de raffinement (directive 2010/63/UE, art. 43). C'est donc le demandeur qui démontre sa propre conformité, dans le document même qui sollicite l'autorisation. Cette démonstration peut prendre la forme d'une affirmation qu'aucune méthode de substitution n'existe, que le document n'a pas à sourcer. Ces trois exigences sont par ailleurs subordonnées à l'objectif du projet : elles cherchent à remplacer les animaux dans un projet donné, elles n'interrogent pas ce projet.
Comment avancer vers la fin de l'expérimentation animale ? · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
L’hypothèse d’une adaptation métabolique des Enterobacteriaceae pour expliquer leur prolifération dans le tractus gastro-intestinal des patients a été explorée lors de travaux in vitro. Dans une optique de développement de rétablissement de la dysbiose, il est nécessaire de valider le rôle potentiel de de la D-serine dans un organisme entier afin de prendre en compte la complexité du tractus intestinal qui intègre à la fois la réponse immunitaire, la structure du tractus digestif ainsi que la présence du microbiote. Il n’existe pas de modèles cellulaires reproduisant la complexité de ces interactions.
2. Réduction
Note de l'OXA. La réduction dont il est question ici porte sur le nombre d'animaux par groupe expérimental, calculé pour que l'analyse statistique tienne. Le total annoncé dans la fiche est une estimation portant sur une autorisation de cinq ans au maximum (code rural, art. R214-123) : il ne dit pas combien d'animaux seront effectivement utilisés, et il ne se rapporte pas à une année.
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
Pour nos expérimentations, nous avons prévu le nombre d’animaux nécessaire pour répondre aux différentes questions scientifiques à la fois pour garder une puissance statistique suffisante dans le traitement de nos résultats, et pour palier l’exclusion de certains animaux au cours de l’expérimentation. Après application d’un test de Grubbs pour repérer et exclure de possibles valeurs aberrantes, un test ANOVA sera appliqué afin d’évaluer l’impact des traitements sur les paramètres mesurés. Il s’agit d’un nombre d’animaux maximal qui sera revu à la baisse en fonction des premiers résultats obtenus qui pourront dans certains cas ne pas nécessiter de répétitions pour valider les observations.
3. Raffinement
Note de l'OXA. Le raffinement nomme une amélioration technique de la procédure, sans dire ce qu'elle change pour l'animal qui la subit. La réglementation impose d'atténuer la douleur, dans une limite qu'elle inscrit elle-même : « pour autant que cela soit compatible avec la finalité de la procédure expérimentale » (code rural, art. R214-109). Ce qui reste de souffrance après cette limite est autorisé. Le raffinement ne porte par ailleurs que sur la procédure : les souffrances de la captivité elle-même, confinement, bruit, lumière, manipulations d'entretien, ne relèvent d'aucun des trois R.
La réglementation est-elle « très stricte » ? · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
Les protocoles expérimentaux ont été raffinés à partir des données de la littérature et de notre expérience antérieure. Les animaux seront maintenus en groupes sociaux de 5 individus dans des cages transparentes pourvues de litière dépoussiérée. Un enrichissement de l’environnement est prévu par ajout de cylindres de coton utilisés par les souris pour confectionner leur nid. Les cages seront placées dans une pièce régulée à 22°C et respectant une photopériode 12 /12. L’ensemble des animaux seront suivis quotidiennement par du personnel qualifié selon une grille de suivi clinique claire comprenant 4 stades distincts établis en fonction de la perte de poids et de l’état visuel des animaux (pelage et comportements). Si les points limites tels que définis dans le projet sont atteints, les souris seront sorties du protocole avec arrêt des traitements. En cas de nécessité, les souris seront euthanasiées selon la réglementation en vigueur.
Expliquer le choix des espèces et les stades de développement y afférents.
Note de l'OXA. Le dossier d'autorisation demande de justifier l'origine des animaux, leur espèce, leur nombre estimé et leur stade de développement (arrêté du 1er février 2013, art. 5). La justification attendue est technique : elle porte sur l'adéquation de l'espèce à l'objectif poursuivi. Ce que l'appartenance à une espèce autorise à faire subir à un individu est une question morale, et le formulaire ne la pose pas. L'appartenance à une espèce, prise seule, ne fonde pourtant pas de différence de statut moral entre des individus également capables de souffrir.
Spécisme et expérimentation animale · Comment lire un résumé non technique
Texte du laboratoire demandeur, reproduit tel quel
La souris est un modèle fréquemment utilisé dans les études de colonisation du tractus digestif par les Enterobacteriaceae ainsi que pour reproduire une inflammation chronique de l’intestin à travers l’utilisation du DSS. Des souris femelles seront utilisés au cours du projet car il est démontré que les hormones males, en particulier la testostérone, influence la composition du microbiote intestinal. Des souris de 6 semaines seront utilisées pour le projet car le microbiote intestinal est stable à ce stade de développement